La magistrada que instruye el caso concluye, asimismo, que José María Andújar, "prevaliéndose de su cargo" y, "en algunos casos, en su beneficio personal", realizó gastos con cargo a la cooperativa, causándole a esta "un perjuicio de 119.453,44 euros". Con respecto a este presunto delito de apropiación indebida, la juez detalla que el que fuera presidente de la mayor cooperativa de tomate de España habría realizado distintos gastos con cargo a la entidad, emitido facturas "carentes de justificante contable o sobreprecio" y, además, en las que "no estaban detallados los conceptos por los que se realizaban".

De este modo, el auto de procedimiento abreviado imputa a Andújar y a González la presunta comisión de delitos de estafa y, además, en el caso del primero, una supuesta apropiación indebida, por lo que da traslado al Ministerio Fiscal y a las dos acusaciones particulares, entre ellas la propia CASI, para que formulen acusación o pidan el sobreseimiento de la causa.

Según la juez, tanto Andújar como González, "de común acuerdo y aprovechando los cargos que ocupaban", habrían autorizado la producción de tomate cocktail "solo a algunos socios de la cooperativa" y con "ánimo de beneficio ilícito", entre ellos, presuntamente, el propio presidente de CASI y algunos familiares. De este modo, ambos habría, incluso, incumplido con las propias bases de la cooperativa de "no impedir o limitar el producto que los agricultores querían plantar para cada campaña".

De este modo, y durante dos campañas consecutivas, la 2012/2013 y la2013/2014, habrían asignado un precio de compra a los cooperativistas de este tipo de tomate de 1,53 euros y 1,24, respecticamente, cuando el precio de venta era de 1,17 y 1,27, respectivamente. Así, el primer año, habría causando pérdidas a la cooperativa superiores a los 700.000 euros, si se tienen en cuenta la comercialización y los gastos de manipulado, envasado y transporte, así como algo más de 526.000 euros el segundo año.