Asimismo, el agricultor puede utilizar fertilizantes que se obtienen a partir de sustancias vegetales o animales. Estos abonos ecológicos presentan varias ventajas para el medio ambiente con respecto a los sintéticos: Por un lado, mejoran las condiciones de la tierra, al aportar los nutrientes de las propias plantas y proteger el suelo de la erosión. Los abonos industriales actúan durante un tiempo antes de plantar, lo que deja a la superficie del cultivo a merced de la erosión del agua y el viento. Además, los abonos naturales mejoran la textura del terreno, permitiendo el establecimiento de una microflora y microfauna beneficiosa para las plantas y el suelo y evitando el exceso de acumulación de minerales. Por otro lado, evitan la contaminación química. Los abonos industriales no pueden ser absorbidos por las plantas en su totalidad, por lo que se produce una acidificación y salinización del suelo. Este tipo de abonos, utilizados en exceso, pueden alterar el suelo e incorporar a las aguas sustancias tóxicas para el medio ambiente y el organismo humano. A pesar de sus ventajas, la utilización de abonos naturales tiene una serie de limitaciones. El rendimiento de los productos industriales suele ser mayor, por lo que es difícil renunciar a ellos especialmente cuando se persigue el beneficio económico. Además, también puede suceder que se produzcan problemas de plagas y de fertilidad hasta que la producción con métodos ecológicos se estabilice, por lo que en tal caso es recomendable un uso prudente de sustancias sintéticas.