El compost de residuos agroindustriales puede mejorar la sanidad de diversos cultivos de una forma natural en vez de química. De esta forma, con material procedente de residuos agroindustriales es posible reducir las efecciones de ciertas enfermedades comunes en los cultivos. A través de esta técnica y gracias a la investigación de grupos científicos como el de "Agronomía" de la Universidad de Sevilla, es posible reducir enfermedades importantes en diferentes cultivos como el tomate o el clavel. Este grupo de investigación sevillano lleva más de diez años trabajando para reducir la incidencia de enfermedades en distintos cultivos. Además, su investigador principal, Manuel Avilés, es uno de los socios fundadores de una empresa surgida de la Universidad de Barcelona (una spin-off) dedicada a la búsqueda, caracterización y comercialización de agentes de control biológico para distintas enfermedades de los cultivos. Uno de los proyectos más importante que desarrolla en estos momentos este grupo de la Escuela de Ingenieros Técnicos Agrícolas junto con la Universidad de Barcelona está dedicado a controlar una enfermedad que afecta al tomate, clavel y melón denominada "Fusariosis vascular". Se trata de una enfermedad grave para los cultivos en todo el mundo de la cual aún no hay un control químico efectivo, y este grupo ha sido capaz de desarrollar varios composts capaces de reducir la Fusariosis en estos cultivos. Esta enfermedad también se puede reducir con agentes de control biológico. Otro de los objetivos de este proyecto es verificar la eficacia de un Trichoderma asperellum como agente de control biológico en otros cultivos comerciales como el clavel, el melón y el pepino.